此刻若将他撤下，新任登莱巡抚不见得就能获得将士缙绅的拥戴信任－－闹不好还会激起兵变――皇帝太了解军队了，这帮子丘八自从天启末年开始就渐渐的变得桀骜不驯起来，凡事先要粮饷，稍有不满就聚众哗变，奈何现在八方走火，四面生烟，到处都要军队来维持……
想到这里，他决定不再撤换孙元化，而是让他继续“戴罪立功”，留在莱州。去年年底他已经将其“降三级留任”，这次他决定不再给他叙功。至于杨御藩，因为前面刚刚打了一个败仗吃了降级的处分，这次叙功撤销处分；至于徐从治和莱州知府朱万年、掖县县令等人都有叙功升赏。另在奏疏后面开列有出力的地方缙绅士民，照例也有封赏。皇帝不再细看，下上谕由礼部酌情办理。
虽说如此，他还是不大放心，最近他对外臣已经渐渐的不信任起来，总觉得不及内臣可靠。因而他决定选择二个可靠又“知兵”的太监去莱州分别为孙元化和徐从治监军。他正在御马监的太监中考虑哪些人比较合适。在他看来最合适的莫过于高起潜。但是高起潜是内臣中少见的“知兵”人才。他觉得应该将他留在更关键的场合使用：一旦登州进剿的安排妥当，也要派遣一名太监监军。
正在沉思，忽然看到正要退出去的司礼监太监曹化淳，他心中不由得一动。曹化淳是当初信王府服侍过他，天启年间被魏忠贤排挤被发配到南京――属于一起受过难的从龙太监，因而对他非常信任。当即问道：
“你在外间，可曾经听说过周延儒和温体仁之间的事情么？”
曹化淳躬身奏道：“奴婢每日在宫中伺候皇爷，外边事只是偶有风闻，况这是朝廷大事，奴婢如何敢说？”
“你只管对朕直说。”
曹化淳好些天前已经受了杨公公的嘱托，收了若干好处，又收到了闲居在家的东林党人钱谦益送来的银子和书启，请他为周延儒说话。钱谦益和他的关系不一样――曹化淳是出自王安的门下，而钱谦益曾经为王安写过墓志铭――因而早就准备为周延儒和孙元化开脱。但是平日里他没有机会当面议论此事，现在经皇上一问，趁机跪下进奏。
奏疏的内容他早就考虑过，主要还是从皇帝最为忌讳的党争入手，暗示这次对孙元化和周延儒的攻击有温体仁和周延儒党争的成分在内。
这番话果然对崇祯产生里影响。他登基以来，最忌讳的就是朝廷的党争，更忌结党。他所以东林虽然在他手上得以平反，但是自崇祯一朝，除了崇祯初年一度“诸正在朝”之外，东林党人始终没能占据中枢要地。他长时间任用被人骂为“阉党余孽”的温体仁担任首辅，就有反制东林的意图在内。他原本就怀疑这其中有党争，现在曹化淳这番含沙射影的话语让他顿时警觉起来。
他让曹化淳退了出去，孙元化他已经不打算撤换，这番话更让他下定了决心，但是就这么饶过孙元化他又有些不甘：登州毕竟是每年八十万两耗费的军事重镇，孙元化丧师失地，就是问成大辟也不过分。他考虑再三，决定将已经突围的原登州官员：监军道王征、登莱道宋光兰革职，发配大同卫。张焘革职，留莱州军前效力。其余人员全部革职削籍。
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